生物化学是探索生命本质的重要微观学科之一。作为大学生物学科学本科生使用的基础教材,本书既传承了生物化学基本理论,又展示了生物化学发展的最新成就。
全书共由五个部分、二十三章组成。第一部分介绍生化系统的环境条件,第二部分介绍生命的化学物质,第三部分介绍物质与能量代谢,第四部分介绍信息传递与调控,第五部分介绍与生物化学研究相关的新技术与新学科。
本书内容全面、系统,深入浅出地介绍了生物化学的教学内容。
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目录
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前言
第一部分 生化系统的环境条件
第一章 水、pH和缓冲剂 3
第一节 导言 3
一、生物体中水的重要性 3
二、水分子的结构 3
第二节 水的性质 3
一、水的极性 3
二、水的溶解性 4
三、水的比热容、蒸发热 4
第三节 水的电离 5
一、水的解离和pH 5
二、酸和碱 5
第四节 缓冲系统 6
第五节 生物机体中的缓冲系统 6
第六节 水在生物机体中的作用 7
习题 8
第二章 细胞是生命活动的基本单位 9
第一节 导言 9
第二节 细胞的结构 9
一、细胞的大小 9
二、细胞结构 9
第三节 原核细胞与真核细胞 12
第四节 细胞的元素组成和分子组成 12
一、细胞的元素组成 12
二、细胞的分子组成 13
习题 13
第二部分 生命物质的化学
第三章 糖类的化学 17
第一节 导言 17
一、糖的定义与元素组成 17
二、糖的分类与命名 17
第三节 单糖的结构和性质 18
一、单糖的开链结构 18
二、单糖的环状结构 20
二、单糖的性质 23
第三节 单糖衍生物 27
一、氨基糖 27
二、糖酶和糖酸 28
三、糖苷 29
第四节 寡糖的结构和性质 30
一、寡糖的定义与命名 30
二、常见寡糖的结构 30
三、寡糖的性质 31
四、环糊精 32
第五节 多糖的结构和性质 33
一、同聚多糖 33
二、杂聚多糖 37
三、复合糖类 40
第六节 糖类物质的生物学功能 41
一、能源 41
二、结构组分 41
三、其他一些重要的生物功能 42
习题 42
第四章 脂类和生物膜化学 44
第一节 导言 44
一、脂质的基本概念 44
二、脂质的分类 44
三、脂质的生理功能 44
第二节 酯酰甘油 45
一、油脂的结构 45
二、油脂的性质 46
第三节 磷脂 48
一、甘油磷脂 48
二、鞘磷脂 50
第四节 固醇及其衍生物 50
一、固醇类 50
二、类固醇 52
第五节 其他脂类 53
一、萜类 53
二、蜡 54
三、糖脂 54
四、脂蛋白 55
第六节 生物膜化学 55
一、生物膜的化学组成 55
二、生物膜结构的主要特征 56
三、生物膜的结构模型 57
四、生物膜的功能 57
五、膜生物工程 59
习题 60
第五章 蛋白质化学 61
第一节 导言 61
第二节 氨基酸 61
一、蛋白质的基本结构单位氨基酸 61
二、氨基酸的性质 65
三、氨基酸的化学反应 68
第三节 肽 72
一、肽的结构 72
二、天然活性肽 73
第四节 蛋白质的分类 75
一、单纯蛋白质 75
二、结合蛋白质 75
第五节 蛋白质的共价结构 76
一、蛋白质的氨基酸组成 76
二、蛋白质分子结构中的化学键 77
三、蛋白质一级结构的测定 79
四、几种典型蛋白质的一级结构 83
第六节 蛋白质的二级结构 83
一、构型与构象 83
二、蛋白质的二级结构 84
三、超二级结构和结构域 87
第七节 蛋白质的三级结构 88
第八节 蛋白质的四级结构 88
第九节 蛋白质的构效关系 89
一、蛋白质一级结构对高级结构的影响 89
二、一级结构与功能的关系 90
三、高级结构与功能的关系 92
第十节 几种典型蛋白质的结构与功能 93
一、纤维状蛋白质(fibrous proteins) 93
三、球状蛋白 94
三、糖蛋白 96
四、脂蛋白 97
第十一节 蛋白质构象分析原理 98
一、蛋白质溶液构象分析的光谱技术原理 98
二、多维核磁共振基本原理 99
三、蛋白质构象的理论预测 100
第十二节 蛋白质的性质 100
一、蛋白质的两性解离和等电点 100
二、蛋白质分子的大小 101
三、蛋白质的肢体性质 103
四、蛋白质的沉淀作用 103
五、蛋白质的变性作用 104
六、蛋白质的颜色反应 105
第十三节 蛋白质及氨基酸的纯化和鉴定技术原理 105
一、蛋白质分离纯化的一般原则 106
二、蛋白质分离纯化的方法 106
三、蛋白质的分析测定 109
习题 112
第六章 核酸化学 113
第一节 导言 113
一、核酸是遗传物质变异的物质基础 113
二、核酸的分类 114
三、核酸的生物功能 115
第二节 核酸的组成成分 118
一、元素组成 118
二、糖组分 118
三、碱基 119
四、核苷 122
五、核苷酸 124
第三节 RNA的结构 127
一、RNA的种类与分布 127
二、RNA的一级结构 129
三、RNA的高级结构 135
第四节 DNA的结构 140
一、DNA的一级结构 140
二、DNA的二级结构 144
三、DNA的三级结构 148
第五节 病毒核酸 150
一、病毒的大小、形态与结构 150
二、病毒核酸 151
第六节 核酸及核苷酸的性质 155
一、性状和溶解度 155
三、核酸及其组分的两性性质 155
三、核酸及其组分的紫外吸收 157
四、核酸的变性与复性 159
第七节 核酸研究技术原理 160
一、核酸及其组分的分离纯化 160
二、核酸及其组分含量的测定 162
三、核酸及其组分的分析鉴定方法 163
四、DNA聚合酶链反应技术 165
五、核酸的分子杂交与印迹技术 166
习题 166
第三部分 物质代谢与能量代谢
第七章 代谢系统必需的催化剂——酶 169
第一节 导言 169
一、酶的概念 169
二、酶的催化特性 170
三、酶的组成 171
第二节 酶的分类 172
第三节 酶结构与功能的关系 173
一、酶的一级结构与催化功能的关系 173
二、酶的活性与其高级结构的关系 174
第四节 酶催化反应的机理 176
一、酶促反应的本质 176
二、酶反应机制 176
第五节 酶反应动力学 178
一、酶促反应的基本动力学 178
二、酶浓度对酶反应速率的影响 182
三、温度对酶反应速率的影响 182
四、pH对酶反应速率的影响 183
五、激活剂对酶反应速率的影响 183
六、抑制剂对酶反应速率的影响 183
第六节 酶的多样性及活性调节 185
一、核酶 186
二、调节酶 186
二、多功能酶 186
四、人工酶 186
第七节 酶活性测定 187
一、定性测定——根据酶催化的反应判断 187
二、活力单位——表示酶量的指标 187
三、比活力——表示酶纯度的指标 188
四、转换数——另一种表示酶催化能力大小的方法 188
五、酶活力的定量测定方法——不同酶选用不同方法 188
习题 188
第八章 代谢系统必需的辅助因子 190
第一节 导言 190
第二节 维生素的命名及分类 190
一、维生素的命名 190
二、分类 190
第三节 水溶性维生素与辅酶 191
一、硫胺素与脱羧辅酶 191
二、核黄素和黄素辅酶 192
三、维生素PP和辅酶I、辅酶II 194
四、吡哆素与维生素B 6195
五、泛酸和辅酶A 196
六、叶酸和叶酸辅酶 197
七、生物素 198
八、维生素B12和辅酶B12 198
九、维生素C 199
十、硫辛酸 201
第四节 脂溶性维生素 202
一、维生素A 202
二、维生素D 204
三、维生素E 205
四、维生素K 206
第五节 铁卟啉及辅基 207
一、铁卟啉辅基 207
二、金属辅基 207
习题 208
第九章 激素 209
第一节 导言 209
一、激素的概念 209
二、激素的类别 209
三、激素的作用机理 210
第二节 高等动物激素 211
一、舍氮激素 212
二、类固醇激素 219
二、肪酸衍生物激素——前列腺素 222
第三节 植物激素 223
一、生长素 223
三、赤霉素 224
三、细胞分裂素 224
四、脱落酸 225
五、乙烯 225
六、其他植物激素 225
第四节 昆虫激素 226
一、昆虫内激素 226
二、昆虫外激素 227
习题 228
第十章 能量代谢与生物能的利用 229
第一节 导言 229
第二节 生物氧化的方式和特点 230
一、生物氧化中CO2的生成方式 230
三、生物氧化中物质氧化的方式 230
三、生物氧化的特点 231
第三节 呼吸酶类 231
一、脱氢酶 231
二、氧化酶 233
二、加氧酶 233
四、传递体 233
第四节 线粒体氧化体系 234
一、呼吸链的概念 234
二、呼吸链的组成成分 234
三、呼吸链中各组分的排列顺序 236
第五节 非线粒体氧化体系 238
一、微粒体氧化体系(加氧体系)238
二、过氧化体氧化体系 239
第六节 植物细胞中的生物氧化体系 240
一、多酚氧化酶体系 240
二、抗坏血酸氧化酶体系 240
三、乙醇酸氧化酶体系 241
第七节 高能磷酸键的生成机制 241
一、生化反应中的自由能及自由能变化 241
二、氧化还原电位与自由能变化 242
三、线粒体膜结构的特点 244
四、高能磷酸键的生成机制 247
五、氧化磷酸化的机制 248
第八节 穿梭作用实现线粒体与胞浆间的能量传递 249
一、磷酸甘油穿梭作用 249
二、苹果酸穿梭作用 250
第九节 生物能量的储存和转移利用 250250
一、ATP末端磷酸基转移给醇型羟基、酰基或胺基,本身变成ADP 251
二、ATP将其焦磷酸基转移给其他化合物,本身变为AMP 251
三、ATP将其AMP转移给其他化合物,本身变为焦磷酸 252
四、ATP将其腺苷转移给其他化合物,本身转变为焦磷酸和正磷酸 252
第十节 氧化与磷酸化的解偶联 252
习题 253
第十一章 糖的分解代谢 254
第一节 糖的消化、吸收和转运 254
一、糖的酶促降解 254
二、糖的吸收 255
三、糖的转运 256
第二节 糖的无氧分解 258
一、糖酵解途径——糖分解代谢的共同阶段 258
二、EMP途径的调节 263
三、无氧分解中丙酮酸的去向 264
四、糖无氧分解的生理意义 265
第三节 糖的需氧分解 266
一、糖的有氧氧化的反应历程 266
二、三羟酸循环的调节 270
三、糖需氧分解的生理意义 271
第四节 磷酸己糖旁路 273
一、磷酸己糖旁路的反应历程 273
三、磷酸己糖旁路的生理意义 276
第五节 其他己糖和戊糖的分解 277
第六节 乙醛酸循环 277
第七节 糖代谢异常 279
一、低血糖 279
二、高血糖 279
三、糖原病 280
习题 280
第十二章 糖的合成代谢 281
第一节 导言 281
第二节 光合作用的一般论述 282
一、光合作用的器官——叶绿体 283
二、光合包素 283
第三节 光反应 285
一、类囊体膜(光合膜)中的两个色素系统 285
二、光反应的电子传递链 286
三、光合磷酸化 286
第四节 暗反应 288
一、卡尔文循环 288
二、暗反应的代谢调控 292
三、C4途径 293
四、景天酸代谢途径 295
第五节 光呼吸 295
第六节 蔗糖与淀粉的合成 297
一、蔗糖的合成 297
二、淀粉的合成 297
第七节 糖原生成作用 298
一、糖原的结构 298
二、糖原的合成 298
第八节 糖异生作用 299
一、糖异生的途径 299
二、糖异生的生理意义 301
三、糖异生的调节 301
第九节 糖原代谢的调节 302
一、糖原代谢的变构调节 302
二、激素的调节 302
习题 303
第十三章 脂质代谢 304
第一节 脂质的消化吸收和转运 304
一、脂类的消化 304
二、脂质的吸收 305
三、血脂的转运 305
第二节 脂肪的分解代谢 306
一、甘油的分解与合成代谢 306
二、脂肪酸的分解代谢 307
第三节 固体代谢 313
一、酮体的生成 313
二、酮体的氧化 314
第四节 脂肪的合成代谢 315
一、a-磷酸甘泊的生成 315
二、脂肪酸的合成代谢 315
三、脂肪酸合成的调节 320
四、三酷甘泊的合成 321
第五节 磷脂代谢 321
一、磷脂的分解代谢 321
二、磷脂的合成代谢 323
第六节 胆固醇代谢 324
一、阻固醇的合成代谢 324
二、胆固障合成的调节 326
三、胆固醇的转化 327
习题 328
第十四章 氮代谢 329
第一节 导言 329
一、蛋白质的消化 329
二、蛋白质的吸收 330
三、蛋白质的转运 331
第二节 氨基酸的分解代谢 331
一、氨基酸的脱氨基作用 331
二、氨基酸的脱竣基作用 335
第三节 鸟氨酸循环 336
一、氨的转运 336
二、氨的排泄 336
三、尿素合成——鸟氨酸循环(Ornithine cycle) 337
第四节 氨基酸的合成代谢 340
一、a-酮戊二酸衍生型(谷氨酸型) 340
二、草酰乙酸衍生型(天冬氨酸型) 342
三、丙酮酸衍生型 343
四、3-磷酸甘油酸衍生型(丝氨酸型) 345
五、磷酸烯酶丙围酸衍生物 346
六、组氨酸生物合成 347
第五节 氨基酸代谢的调节 347
一、氨基酸生物合成的反馈抑制调节 347
二、酶生成量的改变对氨基酸生物合成的调节 347
第六节 核苷酸的分解代谢 348
一、嘌呤核苷酸分解代谢 348
二、嘧啶核苷酸分解代谢 349
第七节 核苷酸的合成代谢 350
一、嘌呤核苷酸的合成 350
二、嘧啶核苷酸的合成 354
三、脱氧核糖核脊酸的合成 355
第八节 生物固氮作用 356
一、固氮生物的类型 356
二、生物固氮 357
习题 358
第十五章 糖、脂类、蛋白质三大物质代谢的关系 359
第一节 导言 359
第二节 糖的有氧代谢与无氧代谢的关系 360
一、糖代谢的概述 360
二、糖各条分解代谢途径间的关系 360
第三节 糖代谢与脂类代谢的关系 361
一、糖转变为脂类 361
二、脂类转变为糖 362
第四节 糖代谢与蛋白质代谢的关系 362
一、糖转变为蛋白质 362
二、蛋白质转变为糖 363
第五节 脂类代谢与蛋白质代谢的关系 363
一、脂肪转变为蛋白质 363
二、蛋白质转变为脂类 364
第六节 三大物质代谢的协调 364
习题 366
第四部分 信息传递系统与调控系统
第十六章 DNA的生物合成——复制 369
第一节 导言 369
第二节 参与DNA复制的酶 369
一、DNA聚合酶 369
二、DNA连接酶 373
三、与解除DNA高级结构有关的酶及蛋白因子 373
四、引物酶 375
第三节 DNA半保留复制 376
第四节 DNA半不连续复制 377
第五节 DNA复制过程 378
一、复制的起始 378
二、新链的延伸(elongation)380
三、复制的终止 381
第六节 原核与真核生物DNA的复制特点 382
一、原核生物DNA的复制 382
二、真核生物DNA的复制 383
三、新链5'末端的复制 384
第七节 DNA重组 385
一、同源重组 386
二、特异位点重组(site-specific recombination) 389
三、转座重组 391
第八节 DNA的反转录合成 395
一、反转录酶 395
二、反转录病毒的基因组 395
三、反转录过程 396
四、反转录的生物学意义 396
第九节 DNA损伤修复 397
一、DNA损伤 397
二、错配修复 397
三、直接修复 397
四、切除修复 398
五、重组修复 398
六、应急反应和易错修复 399
习题 399
第十七章 RNA的生物合成——转录 401
第一节 导言 401
第二节 参与RNA合成的酶 401
一、RNA聚合酶 401
二、RNA复制酶 403
三、多核背酸磷酸化酶 405
第三节 转录机制 405
一、转录起始 405
二、转录延伸——依赖于DNA的合成 410
三、转录终止 410
第四节 转录方式 411
一、对称转录——DNA两条链都作为模板 411
二、不对称转录——DNA两条链中仅一条链作为模板 411
第五节 转录后加工 412
一、RNA的催化剪切 412
二、mRNA的转录后加工 416
三、rRNA的转录后加工 420
四、tRNA的转录后加工 421
五、RNA生物功能的多样性 422
第六节 核酸生物合成的抑制剂 423
一、核背酸合成抑制剂 423
二、与DNA模板结合的抑制剂 424
三、作用于RNA聚合酶的抑制剂 424
习题 425
第十八章 蛋白质的生物合成 426
第一节 导言 426
第二节 遗传密码 427
一、遗传密码的破译 427
二、遗传密码的特性 429
第三节 核糖体 430
一、核糖体的组成 431
二、核糖体的功能 431
三、多聚核糖体 432
第四节 氨基酸的活化——氨酰tRNA的合成 433
一、氨基酸与tRNA连接的反应 433
二、氨基酰tRNA合成酶 433
三、氯基酰tRNA合成酶可识别特定底物 435
第五节 起始密码子与起始tRNA 436
一、起始密码子 436
二、起始tRNA 436
第六节 翻译过程 437
一、密码子的识别 437
二、蛋白质合成的起始 437
三、肤链延伸(elongation)439
四、肤链合成终止 441
第七节 翻译后修饰加工 442
一、N末端甲硫氨酸的切除 442
二、氨基酸残基的修饰 443
三、肤链的水解修饰 443
第八节 蛋白质的分泌及转运 443
一、信号肤引导蛋白质的转运 443
二、线粒体和叶绿体蛋白质的运输 445
三、细菌蛋白质的运输 445
第九节 基因表达的抑制剂 445
一、抗生素 445
二、毒素 446
三、抗代谢物 446
习题 447
第十九章 代谢调控 449
第一节 导言 449
第二节 能量代谢的调节 449
一、能荷调节 450
二、糖代谢的调节 450
三、脂代甜的调节 451
第三节 物质代谢调节的方式和水平 452
一、细胞水平的调节 452
二、激素的调节作用 453
三、神经系统的调节 454
第四节 酶活性的调节和反馈调节 455
一、酶的共价修饰 455
二、酶亚基的聚合和解聚 456
三、反馈调节 457
四、激活剂和抑制剂对酶活性的影响 459
第五节 酶量的调节 460
一、酶的诱导合成 460
二、酶合成的阻遏作用 461
三、诱导与阻遏的机制 461
第六节 基因表达的调控 461
一、原核生物基因表达的调节 461
二、真核生物基因表达的调节 464
习题 466
第二十章 细胞化学信号转导 467
第一节 导言 467
第二节 细胞间化学信号的种类 467
一、细胞间化学信号 468
二、细胞内化学信号 469
第三节 受体的调控及转导 470
一、膜受体 470
二、胞内受体 473
三、受体的性质 473
四、受体的调节 474
五、受体调节的特点 474
第四节 cAMP及cGMP转导系统 476
一、cAMP-蛋白激酶A途径 476
二、cGMP-蛋白激酶G途径 479
第五节 IP3及DG转导途径 481
一、IP3和DG产生与灭活 481
二、IP3的第二信使作用 481
三、DG-蛋白激酶C途径 482
第六节 钙离子转导途径 483
一、Ca2+的第三信使作用 483
二、Ca2+-钙调蛋白途径 484
第七节 酷氨酸激酶及磷酸酶转导系统 485
一、酶氨酸蛋自激酶 485
二、酷氨酸蛋白磷酸酶 486
习题 489
第五部分 与生物化学研究相关的新技术与新学科
第二十一章 生物工程概论 493
第一节 导言 493
第二节 基因工程 493
第三节 细胞工程 494
第四节 酶工程 494
第五节 生化工程 494
第六节 生物工程的应用 495
一、化工及冶金工业 495
二、轻工和食品工业 495
三、生物工程用于农业和畜牧业 495
四、生物工程与医药 496
五、生物工程在环境保护中的应用 496
习题 497
第二十二章 基因工程和蛋白质工程 498
第一节 导言 498
第二节 基因工程的工具酶 498
一、限制性内切酶的发现与分类 498
二、甲基化酶 500
三、T 4-DNA连接酶 500
四、核酸酶 500
五、聚合酶 501
六、反转录酶 501
七、DNA加工酶 501
第三节 目的基因的获得 502
一、通过分离法获得目的DNA 502
二、通过合成法获得目的基因 502
第四节 基因载体 503
一、载体的功能及其特征 503
二、质粒 504
三、噬菌体 505
第五节 外源DNA片段与载体的连接 506
一、连接方法 506
二、重组率 507
第六节 重组DNA导入宿主细胞与筛选 507
一、转化:带有目的基因的载体进入受体细胞 507
二、筛选:从大量受体细胞中选出带有重组体的细胞 507
第七节 克隆基因的表达 509
第八节 蛋白质工程 510
一、蛋白质工程的概念 510
二、基因定点突变 510
三、蛋白质设计 511
第九节 蛋白质工程的一般技术 511
一、蛋白质工程的理论设计 511
三、定点突变技术 512
第十节 蛋白质工程酶 514
一、改变酶的催化活性 514
二、改变酶的底物专一性 514
三、提高酶的稳定性 514
四、改变酶的反应特性 514
五、产生新酶 514
第十一节 蛋白质药物研制 514
一、β-干扰素 514
二、白细胞介素 2514
三、膜岛素 514
习题 515
第二十三章 生物化学与现代新生物技术 517
第一节 导言 517
第三节 基因组学和后基因组学 517
一、基因组和基因组学的概论 517
二、基因组图谱 519
三、人类基因组研究(study of the human genome) 521
第三节 蛋白质组学 523
一、蛋白质组学概述 523
二、蛋白质组研究的技术体系 524
三、蛋白质组学的应用前景 527
第四节 生物信息学 527
一、生物信息学的含义 527
二、生物信息学的基本研究方法 528
三、生物信息学的主要研究内容 528
第五节 生物芯片 531
一、生物芯片的类别和特点 531
二、生物芯片技术 532
三、生物芯片的应用 535
习题 537
主要参考文献 538