生物进化论解释了生物多样性形成的原因和由来。然而，生物种类丰富多样，形态千差万别，特定生物或类群的进化及其分布过程、历史和式样各具特色，对它们的分类、描记、命名和重建需要遵循科学的原理、方法和规范。本书综合最新研究成果和动态，用富有个性化的语言深入浅出地对生物进化论及生物系统学的原理和方法进行了详细的介绍和探讨。对生物学中争论的热点内容也有所涉及。
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前言
第1章 多样的物种 1
1.1 物种数目 2
1.2 物种在地球上的分布 8
第2章 生物进化思想的产生和发展 10
2.1 宇宙和生命的诞生 10
2.1.1 宇宙的起始 10
2.1.2 宇宙是如何诞生的 11
2.1.3 宇宙是何时开始的 12
2.1.4 地球的诞生 13
2.1.5 生命的诞生 14
2.2 进化论产生 14
2.3 生物进化的例证 18
2.3.1 生物进化的直接证据——化石 18
2.3.2 孑遗生物 19
2.3.3 同源器官 19
2.3.4 趋同 19
2.3.5 保护色和拟态 19
2.3.6 协同进化 19
2.3.7 进化辐射 20
2.3.8 痕迹器官和特殊构造 20
2.3.9 进化事件 21
2.3.10 人工选择 21
2.3.11 人工进化实验 22
2.4 共同由来的经典例证 22
2.4.1 形态学证据 22
2.4.2 胚胎学证据 22
2.4.3 生理生化证据 23
2.4.4 生物地理学证据 23
2.4.5 分子生物学证据 23
2.4.6 生物系统学证据 24
2.5 进化论的发展 24
2.5.1 遗传的物质基础 24
2.5.2 新达尔文主义 27
2.5.3 综合进化论 28
2.5.4 新综合进化论 28
2.6 现代进化论面临的挑战 29
2.6.1 分子进化 29
2.6.2 中性论 30
2.6.3 间断平衡论 31
第3章 自然选择 32
3.1 种群 32
3.2 自然选择的基础： 遗传变异 32
3.2.1 遗传变异的证明 33
3.3 种群内基因频率的改变 34
3.3.1 哈迪温伯格平衡 35
3.3.2 自然选择 35
3.3.3 自然选择的例证 36
3.4 自然选择的外在表现 37
3.4.1 单向性选择 38
3.4.2 稳定性选择 39
3.4.3 分裂性选择 39
3.4.4 平衡性选择 40
第4章 性选择 41
4.1 性的意义 41
4.2 性别产生过程 43
4.2.1 为什么大多数生物只有两性 43
4.2.2 性别产生需要多少个基因参与 44
4.3 性选择产生原因 44
4.4 性选择方式 45
4.4.1 性内选择 45
4.4.2 性间选择 48
4.5 雌雄角色的多样性 50
4.6 动物的婚配制度 51
4.7 植物的性系统 53
4.8 性选择的结果 54
第5章 自然选择的单位 56
5.1 群选择 58
5.2 亲选择 61
5.2.1 亲选择理论 61
5.2.2 绿胡须效应 64
5.2.3 亲子冲突 65
5.2.4 同胞相残 66
5.2.5 互惠利他 66
5.3 动物社会性的起源和进化 66
5.3.1 社会性起源 66
5.3.2 社会性起源：多少基因 68
5.4 配子选择 69
5.5 物种及其他水平的选择 70
第6章 影响进化的其他力量 72
6.1 突变 72
6.2 基因流动 73
6.3 近亲繁殖 74
6.4 遗传漂变 76
6.4.1 奠基者效应 77
6.4.2 瓶颈效应 78
第7章 进化的结果——适应 80
7.1 保护色 81
7.1.1 隐身色 81
7.1.2 反阴影色 81
7.1.3 迷彩色 82
7.2 警戒色 82
7.3 拟态 84
7.3.1 贝氏拟态 84
7.3.2 缪氏拟态 85
7.3.3 波氏拟态 85
7.3.4 瓦氏拟态 85
7.3.5 集体拟态 86
7.4 特化 86
7.5 适应的相对性 87
7.6 进化的方向 88
7.7 进化的速度 88
7.8 当前仍在进化吗？ 89
第8章 物种概念 90
8.1 模式物种概念 91
8.2 唯名论的物种概念 92
8.3 生物学物种概念 94
8.4 识别物种概念 102
8.5 进化物种概念 102
8.6 系统发育物种概念 103
8.7 内聚物种概念 105
8.8 调和物种概念 105
8.9 基因簇物种定义 106
第9章 物种形成 109
9.1 物种形成过程 109
9.2 物种形成方式 111
9.2.1 异域种化 111
9.2.2 同域种化 113
9.2.3 邻域物种形成 116
9.3 再次同域 117
9.4 种化的速度 119
9.4.1 影响种化速度的因素 120
9.5 种化的极端方式 121
9.5.1 物种灭绝 122
9.5.2 适应辐射 122
9.6 种化模式 125
第10章 物种分类 127
10.1 分类特征 127
10.2 基本分类阶元层次及分类单元 131
10.3 检索表 134
第11章 高级分类单元的性质和进化 136
11.1 高级分类单元的起源 136
11.2 决定体制和形态的因素 137
11.3 高级分类单元的进化 138
11.4 高级分类单元的性质 139
第12章 物种命名概要 141
12.1 命名的必要性 141
12.2 生物命名法规要点 141
12.2.1 拉丁文字 142
12.2.2 双名 142
12.2.3 三名 143
12.2.4 种名的变动 143
12.2.5 语法 144
12.2.6 发表与模式 144
12.2.7 优先律 145
12.2.8 高级分类单元的名称 146
12.2.9 确立新分类单元 147
第13章 支序系统学简介 148
13.1 缘起 148
13.2 分支过程的推导 150
13.2.1 共祖近度 150
13.2.2 同源特征与异源同形 152
13.2.3 特征衍化 153
13.2.4 使用共有衍征推导分支过程 155
13.2.5 支序分析的程序化 160
13.2.6 合意 163
13.2.7 分支图与系统树的关系 163
13.3 形式分类 164
13.3.1 单系群 164
13.3.2 支序系统学的分类原则 166
第14章 进化分类学派及其与支序分类学派的论战 169
14.1 进化分类学派与支序分类学派的异同 169
14.2 论战 171
争论一：单系群的定义 171
争论二：系统发育概念和亲缘关系 171
争论三：祖先 172
争论四：时间种 173
争论五：化石 173
争论六：进化级 174
争论七：祖先分类单元 174
争论八：相似程度 175
争论九：特征间隔 175
争论十：生物学 175
争论十一：进化过程 176
争论十二：进化趋势 176
争论十三：分类系统与分支图的一致性 177
争论十四：分类系统的稳定性 177
争论十五：二分支还是多分支？ 178
争论十六：向上分类还是向下分类 178
争论十七：自然分类还是人为分类 178
争论十八：种类平衡 179
争论十九：分类层次 179
争论二十：谁更接近达尔文 182
第15章 数值分类学派 183
15.1 数值分类学派的主要主张 184
15.2 数值分类程式 184
15.2.1 确定分类操作单元 184
15.2.2 选择特征并数量化 184
15.2.3 特征处理 185
15.2.4 计算 185
15.2.5 根据相似度进行运算和归群并作表型图 189
15.2.6 形式分类 189
15.3 评论 189
第16章 分子系统学简介 192
16.1 分子系统学研究的主要步骤 192
16.1.1 选择要研究的类群 192
16.1.2 采集标本 193
16.1.3 确定分子标记 193
16.1.4 纯化基因 193
16.1.5 测序 193
16.1.6 寻找同源序列 193
16.1.7 比对 193
16.1.8 确定序列长度 195
16.1.9 构树 196
16.1.10 方法和树的选择 200
16.1.11 评价树 200
16.1.12 讨论和比较 202
16.2 评论 202
第17章 生物地理学概要 204
17.1 扩散与隔离分化 204
17.1.1 扩散理论 205
17.1.2 隔离分化理论 205
17.2 生物分布格局进化假说 206
17.2.1 大陆漂移假说 206
17.2.2 太平洋洲假说 207
17.2.3 地球膨胀假说 208
17.3 生物地理学的流派及分析方法 208
17.3.1 泛生物地理学 208
17.3.2 系统发育生物地理学 208
17.3.3 分支生物地理学 209
17.3.4 特有简约性分析 210
17.3.5 分子标记的生物地理学分析 210
17.4 地理区划 210
参考文献 212
附录1 部分常见生物种名释义(中文) 231
附录2 部分常见生物种名释义(拉丁文) 246
附录3 部分常见生物命名词汇表(中文西文对照) 261
附录4 部分常见生物命名词汇表(西文中文对照) 269
中文索引 287
西文索引 294
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