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分子生物学与生物技术中的计算:实验室数学指南(原著第2版)


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分子生物学与生物技术中的计算:实验室数学指南(原著第2版)
  • 书号:9787030306197
    作者:Frank H. Stephenson
  • 外文书名:Calculations for Molecular Biology and Biotechnology:A Guide to Mathematics in the Laboratory(Second Edition)
  • 装帧:精装
    开本:16开
  • 页数:480
    字数:711000
    语种:英文
  • 出版社:科学出版社
    出版时间:2011-04-01
  • 所属分类:Q7 分子生物学
  • 定价: ¥128.00元
    售价: ¥101.12元
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  本书的目录已经译成中文,正文部分保留英文原版。另附大连理工大学数学科学学院王天明教授所作导读一篇。
  《分子生物学与生物技术中的计算:实验室数学指南》(原著第2版)是一本实验室必备的案头手册。本书能使读者快速区分哪一项计算是推进研究所必需的。经过更新的第二版提供了互联网上的各种工具,可以用于快速分析实验室常见的一些数学问题。作为一本理想的实验手册,本书适用于生物技术领域的科学家、工程师、教师和学生。
  本书特点:包含常规实验计算所需的全部信息;以循序渐进的方式演示计算实例;对分子生物学和生物技术实验中的数学问题给予全面指导。
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目录

  • 第一章 科学计数法与公制前缀
    引言
    1.1 有效数字
    1.1.1 在计算中有效数字的四舍五入
    1.2 指数和科学计数法
    1.2.1 用科学计数法计数
    1.2.2 科学计数法与十进制计数法之间的转换
    1.2.3 科学计数法中加法和减法的表达
    1.2.4 科学计数法中乘法和除法的表达
    1.3 公制前缀
    1.3.1 转换因子和消去项
    小结
    第二章 溶液、混合液和培养基
    引言
    2.1 稀释计算——一般方法
    2.2 用X因子浓缩
    2.3 配制百分比浓度溶液
    2.4 稀释百分比浓度溶液
    2.5 摩尔和分子量的定义
    2.5.1 摩尔浓度
    2.5.2 在有含水化合物的水中配制摩尔溶液
    2.5.3 稀释摩尔溶液
    2.5.4 将摩尔浓度转换成百分比
    2.5.5 将百分比转换成摩尔浓度
    2.6 当量浓度
    2.7 pH
    2.8 pKa和Henderson-Hasselbalch方程
    小结
    第三章 细胞生长
    3.1 细菌生长曲线
    3.1.1 取样数据
    3.2 控制细胞浓度
    3.3 在线性图中绘制OD550随时间变化的曲线
    3.4 在线性图中绘制OD550的对数值随时间变化的曲线
    3.4.1 对数
    3.4.2 样品的OD550转换成对数值
    3.4.3 绘制OD550的对数值随时间变化的曲线
    3.5 绘制细胞浓度的对数值随时间变化的曲线
    3.5.1 确定对数值
    3.6 计算世代时间
    3.6.1 斜率与细胞生长常数
    3.6.2 世代时间
    3.7 在半对数坐标系中绘制细胞生长数据曲线
    3.7.1 在半对数坐标系中绘制OD550随时间变化的曲线
    3.7.2 根据OD550随时间变化的半对数曲线估算世代时间
    3.8 在半对数坐标系中绘制细胞浓度随时间变化的曲线
    3.9 根据细胞浓度随时间变化的半对数曲线直接估算世代时间
    3.10 在半对数坐标系中绘制细胞密度与OD550的曲线
    3.11 波动试验
    3.11.1 波动试验的例子
    3.11.2 方差
    3.12 突变率的计算
    3.12.1 泊松分布
    3.12.2 利用泊松分布计算突变率
    3.12.3 根据波动试验数据利用绘图法计算突变率
    3.12.4 采用涂板法确定突变率
    3.13 血球计数法测定细胞浓度
    小结
    参考文献
    第四章 噬菌体
    引言
    4.1 感染的多重性
    4.2 概率和感染多重性
    4.3 噬菌体效价的测定
    4.4 噬菌体稀释
    4.5 裂解量的测定
    小结
    第五章 核酸定量测定
    5.1 紫外分光光度法测定核酸含量
    5.2 测定双链DNA的浓度
    5.2.1 利用吸光度和消光系数计算双链DNA的浓度
    5.2.2 采用毫摩尔(mM)为单位计算DNA浓度
    5.2.3 利用PicoGreen®测定DNA浓度
    5.3 测定单链DNA分子的浓度
    5.3.1 用μg/mL表示单链DNA的浓度
    5.3.2 用pmol/μL测定大分子量单链DNA的浓度
    5.3.3 用mM表示单链DNA的浓度
    5.4 寡核苷酸定量
    5.4.1 光学密度(OD)单位
    5.4.2 用μg/mL表示寡核苷酸浓度
    5.4.3 用pmol/μL表示寡核苷酸浓度
    5.5 RNA浓度的测定
    5.6 分子量、摩尔浓度和核酸片段的长度
    5.7 用琼脂糖凝胶电泳法(EB染色)测定DNA浓度
    小结
    第六章 用放射性同位素标记核酸
    引言
    6.1 放射性单位—居里(Ci)
    6.2 估算质粒的拷贝数
    6.3 用缺口平移法标记DNA
    6.3.1 缺口平移法确定放射性标记的标记率
    6.3.2 计算缺口平移产物的特定放射量
    6.4 随机引物标记DNA
    6.4.1 随机引物标记——标记率
    6.4.2 随机引物标记——计算理论产量
    6.4.3 随机引物标记——计算实际产量
    6.4.4 随机引物标记——计算产物的比活性
    6.5 用末端转移酶标记3\\\'端
    6.5.1 用末端转移酶标记3\\\'端——标记率
    6.5.2 用末端转移酶标记3\\\'端——产物的比活性
    6.6 互补DNA(cDNA)合成
    6.6.1 第一链cDNA合成
    6.6.2 第二链cDNA合成
    6.7 同聚物加尾
    6.8 体外转录
    小结
    第七章 寡核苷酸合成
    引言
    7.1 合成产量
    7.2 用DMT Cation Assay计算阶段产量和总产量
    7.2.1 总产量
    7.2.2 阶段产量
    7.3 每一步反应中碱基所增加的核苷的微摩尔量
    小结
    第八章 聚合酶链式反应(PCR)
    引言
    8.1 模板与扩增
    8.2 指数扩增
    8.3 PCR效率
    8.4 计算靶序列的Tm
    8.5 引物值
    8.6 引物Tm
    8.6.1 基于盐浓度、G/C含量和DNA长度计算Tm
    8.6.2 基于最近邻相互作用计算Tm
    8.7 脱氧核苷三磷酸(dNTPs)
    8.8 DNA聚合酶
    8.8.1 计算DNA聚合酶的误差率
    8.9 定量PCR
    小结
    参考文献
    扩展阅读
    第九章 实时聚合酶链式反应(Real Time-PCR)
    引言
    9.1 实时PCR的阶段
    9.2 控制
    9.3 用探针法检验绝对定量
    9.3.1 准备标准
    9.3.2 基于基因拷贝数准备量化聚合酶链式反应(qPCR)标准曲线
    9.3.3 标准曲线
    9.3.4 标准方差
    9.3.5 线性回归和标准曲线
    9.4 扩增效率
    9.5 计算基因表达
    9.6 相对量化-ΔΔCT方法
    9.6.1 2-ΔΔCT方法——确定内参
    9.6.2 2-ΔΔCT方法——扩增效率
    9.6.3 2-ΔΔCT方法——是受实验处理影响的参考基因?
    9.7 相对标准曲线方法
    9.7.1 相对定量的标准曲线方法
    9.8 通过反应动力学相对定量
    9.9 相对定量的R0方法
    9.10 Pfaffl模型
    小结
    参考文献
    扩展阅读
    第十章 DNA重组
    引言
    10.1 限制性核酸内切酶
    10.1.1 限制性核酸内切酶的切点频率
    10.2 计算酶切片段末端量
    10.2.1 多酶切的片段末端量
    10.3 连接
    10.3.1 利用λ-衍生载体连接
    10.3.2 重组λ基因组的组装
    10.3.3 利用质粒载体连接
    10.3.4 转化效应
    10.4 基因组文库——你需要多少克隆?
    10.5 cDNA文库——多少克隆足以构成文库?
    10.6 表达文库
    10.7 用DNA探针杂交筛选重组文库
    10.7.1 寡核苷酸探针
    10.7.2 杂交条件
    10.7.3 利用双链DNA探针杂交
    10.8 利用凝胶电泳确定DNA片段大小
    10.9 利用BAL31核酸酶嵌套切除
    小结
    参考文献
    第十一章 蛋白质
    引言
    11.1 由蛋白质序列计算蛋白质分子量
    11.2 用280nm吸收值测定蛋白质含量
    11.3 利用吸收系数和消光系数估算蛋白质浓度
    11.3.1 吸收系数与摩尔消光系数之间的联系
    11.3.2 确定蛋白质消光系数
    11.4 mg/ml浓度与摩尔浓度之间的联系
    11.5 用280nm吸收值测定有DNA污染的蛋白质浓度
    11.6 用205nm吸收值测定蛋白质浓度
    11.7 用205nm吸收值测定有DNA污染的蛋白质浓度
    11.8 用比色法测定蛋白质浓度——Bradford分析
    11.9 β-半乳糖苷酶应用于启动子活性和基因表达
    11.9.1 在细胞培养中检测β-半乳糖苷酶
    11.9.2 比活性
    11.9.3 分析纯化提取物中的β-半乳糖苷酶活性
    11.10 薄层色谱法(TLC)和保留因子(Rf)
    11.11 凝胶过滤法估算蛋白质分子量
    11.12 氯霉素乙酰转移酶(CAT)检测
    11.12.1 计算氯霉素乙酰转移酶的分子
    11.13 在报告分析中使用荧光素酶
    11.14 体外翻译——测定氨基酸整合率
    11.15 蛋白质的等电位点(pI)
    小结
    参考文献
    扩展阅读
    第十二章 离心法
    引言
    12.1 相对离心力(g)
    12.1.1 g与rpm的转换
    12.1.2 用列线图计算g和rpm
    12.2 计算沉降时间
    小结
    参考文献
    扩展阅读
    第十三章 法医学和父子关系
    引言
    13.1 等位基因与基因型
    13.1.1 计算基因型频率
    13.1.2 计算等位基因频率
    13.2 Hardy-Weinberg方程与期望基因型频率的计算
    13.3 卡方检验(χ2检验):观测值与期望值的比较
    13.3.1 样本方差
    13.3.2 样本标准差
    13.4 Pi:包含力
    13.5 Pd:分辨力
    13.6 DNA分型和加权平均
    13.7 乘法法则
    13.8 父权指数
    13.8.1 当母系基因型未知时计算父权指数(PI)
    13.8.2 组合父权指数(CPI)
    小结
    参考文献
    扩展阅读
    附录A
    索引
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