作为国内首部系统展示马麝保护研究的专业书籍，本书全面梳理了贺兰山分布的马麝种群现状、微生境选择、生境适宜性、食性与采食营养策略、肠道微生物适应性，以及种群遗传学特征与扩散模式等内容。在此基础上，提出了针对边缘隔离种群的保护与管理对策。本书不仅展现了贺兰山作为“生态孤岛”对马麝生存格局的深远影响，也揭示了马麝在适应边缘生境和维持种群稳定性方面的重要生态学特征。
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目录
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第1章 马麝与麝类概况 1
1.1 马麝 2
1.1.1 马麝的一般特征 2
1.1.2 马麝的空间分布 2
1.1.3 马麝的亚种分化 2
1.2 麝科动物的分类系统 3
1.2.1 中国的麝科动物 3
1.2.2 麝类分类演变历史 3
1.3 麝类种群现状 4
1.4 麝类家域及栖息地 5
1.4.1 麝类家域大小 5
1.4.2 麝类生境选择 6
1.4.3 麝类栖息地适宜性 7
1.5 麝类保护现状 7
1.5.1 经济价值及面临的威胁 7
1.5.2 政策法规的实施 8
参考文献 9
第2章 贺兰山马麝种群的数量和分布12
2.1 贺兰山马麝种群监测技术 13
2.1.1 样线法 13
2.1.2 红外相机法 14
2.2 贺兰山马麝种群数据处理 16
2.2.1 分布范围的确定 16
2.2.2 种群数量的估计 16
2.3 贺兰山马麝生态现状 17
2.3.1 空间分布格局 17
iv 贺兰山马麝生态适应性与保护研究
2.3.2 种群数量估计 19
2.3.3 影响因素 19
2.3.4 人为干扰 21
2.4 贺兰山马麝种群动态分析 22
2.4.1 马麝种群数量监测方法探讨 22
2.4.2 马麝种群分布 23
2.4.3 马麝种群数量变化 23
2.4.4 马麝种群影响因素分析 24
参考文献 24
第3章 贺兰山马麝的微生境26
3.1 贺兰山马麝微生境监测技术 27
3.1.1 样线设置 27
3.1.2 样方设置 27
3.1.3 生态因子选择及测定 28
3.2 贺兰山马麝的微生境数据处理 29
3.2.1 非数值因子 29
3.2.2 数值因子 29
3.2.3 独立样本 29
3.2.4 Marcum法的应用 29
3.3 贺兰山马麝的微生境选择 29
3.3.1 春季微生境选择 29
3.3.2 夏季微生境选择 31
3.3.3 秋季微生境选择 33
3.3.4 冬季微生境选择 34
3.3.5 枯草期和青草期的生境差异 36
3.4 贺兰山马麝栖息地选择与动态变化 37
3.4.1 马麝栖息地选择的季节性 37
3.4.2 马麝枯草期与青草期栖息地选择 38
参考文献 39
第4章 贺兰山马麝的生境适宜性 40
4.1 贺兰山马麝的生境数据采集及处理 41
4.1.1 MaxEnt模型的应用 41
4.1.2 样线布设 41
4.1.3 数据的提取 42
4.1.4 模型检验与生境等级划分 42
4.2 贺兰山马麝的生境适宜性评价 43
4.2.1 MaxEnt模型预测 43
4.2.2 环境变量对贺兰山马麝分布的影响 43
4.2.3 贺兰山马麝生境适宜性分布 45
4.3 贺兰山马麝生境评价及保护策略 46
4.3.1 生态因子的选取及评价 46
4.3.2 生态位模型的选用与模型数据的输入 46
4.3.3 贺兰山马麝的保护建议 47
参考文献 48
第5章 贺兰山马麝的食性50
5.1 粪便显微分析法在马麝食性研究中的应用 51
5.1.1 粪便显微分析法的原理 51
5.1.2 马麝的食物和粪便样品获取 51
5.1.3 显微装片的制备 52
5.1.4 显微装片的镜检和物种鉴定 52
5.2 贺兰山马麝的食物数据处理 52
5.2.1 镜检结果计算与分析 52
5.2.2 食物组成及多样性分析 53
5.3 贺兰山马麝的食物组成及差异 53
5.3.1 春季的食物组成 53
5.3.2 夏季的食物组成 55
5.3.3 秋季的食物组成 58
5.3.4 冬季的食物组成 59
5.3.5 食物组成的季节性 62
5.4 贺兰山马麝食物适应性及数据优化 63
5.4.1 粪便显微分析法误差及改进策略 63
5.4.2 贺兰山马麝对食物的适应 64
参考文献 65
第6章 贺兰山马麝的采食营养策略67
6.1 贺兰山马麝采食样品采集及测量 68
6.1.1 植物样品的采集与保存 68
6.1.2 测量方法 68
6.1.3 数据处理 70
6.2 贺兰山马麝食物的营养成分与采食对策 70
6.2.1 食物的营养成分及次生代谢产物 70
6.2.2 采食对策选择 78
6.3 食物营养成分对马麝食物选择的影响及评价 80
6.3.1 食物营养成分及物质对马麝食物选择的作用 80
6.3.2 贺兰山马麝的食物选择及综合评价 81
参考文献 82
第7章 圈养和野生马麝的肠道菌群 86
7.1 马麝肠道菌群研究步骤 87
7.1.1 粪便样品获取 87
7.1.2 总DNA提取 89
7.1.3 粪便微生物16S rRNA 文库构建 89
7.1.4 宏基因组文库构建 90
7.1.5 粪便微生物生物信息学分析 91
7.2 肠道菌群结构表征 94
7.2.1 测序深度及样本量检验 94
7.2.2 圈养和野生马麝冬季肠道菌群结构 97
7.2.3 圈养和野生马麝冬季肠道核心菌群 100
7.3 肠道菌群多样性分析 104
7.3.1 α多样性 104
7.3.2 β多样性 106
7.3.3 肠道菌群差异物种 108
7.4 马麝肠道菌群功能注释与关联 111
7.4.1 冬季肠道微生物基因及物种丰度 111
7.4.2 冬季肠道菌群功能 117
7.4.3 食性和肠道菌群的关联 122
7.5 马麝肠道菌群适应性 126
7.5.1 马麝肠道菌群对食物的适应 126
7.5.2 马麝肠道菌群多样性影响因素 127
7.5.3 马麝肠道菌群功能基因差异 129
参考文献 132
第8章 贺兰山马麝种群遗传学 136
8.1 马麝种群遗传学研究技术 138
8.1.1 基因组DNA提取 138
8.1.2 引物筛选及反应体系 140
8.1.3 数据处理与分析 142
8.2 贺兰山马麝种群遗传学特征 144
8.2.1 样本扩增 144
8.2.2 线粒体序列 144
8.2.3 个体识别与性别鉴定 144
8.2.4 种群遗传多样性 145
8.2.5 种群遗传结构 148
8.2.6 种群历史动态 156
8.3 贺兰山马麝种群遗传多样性与动态 157
8.3.1 马麝粪便样品保存与扩增分析 157
8.3.2 基于线粒体和微卫星标记的马麝种群遗传多样性 158
8.3.3 马麝种群遗传分化和历史动态 159
参考文献 161
第9章 贺兰山马麝种群的扩散模式 165
9.1 马麝扩散模式分析流程 166
9.1.1 数据来源和选取 166
9.1.2 数据分析方法 167
9.2 马麝种群扩散模式表征 167
9.2.1 空间自相关 167
9.2.2 两性Fst 比较 168
9.2.3 分配检验 169
9.2.4 亲缘关系 169
9.2.5 近期扩散事件 170
9.3 马麝扩散模式与保护管理策略 171
9.3.1 马麝扩散模式及驱动因素 171
9.3.2 马麝保护与管理对策 172
参考文献 173
第10章 贺兰山马麝保护与管理规划175
10.1 保护与管理规划的背景 176
10.2 保护与管理规划的必要性 176
10.3 保护与管理规划的目标 178
10.3.1 远期规划（2035年及以后） 178
10.3.2 中期规划（2030～2035年） 178
10.3.3 近期规划（2030年前） 178
10.4 内容和指南 179
10.4.1 栖息地保护、恢复与修复 179
10.4.2 基于遗传多样性的保护网络与廊道设计 180
10.4.3 人为干扰的多维度管控 183
10.4.4 管理部门保护能力的系统性提升 183
10.4.5 科普宣传与社区参与的协同推进 184
10.4.6 法律法规与政策制度的完善及落地实施 185
10.4.7 先进监测技术的应用与本土化开发 186
10.4.8 长效的种群及栖息地调查体系构建 187
10.4.9 马麝种质资源的保护与可持续利用 188
10.5 保护战略对接 188
10.5.1 与国家生物多样性保护战略的对接 188
10.5.2 与省级自然保护体系和规划的衔接 189
10.5.3 与区域生态修复和绿色发展规划的结合 190
10.5.4 与国际濒危物种保护与合作机制的接轨 190
10.5.5 构建多层级联动的保护协调与保障机制 190
10.6 资金筹措及来源 191
10.6.1 保护资金需求分析 191
10.6.2 资金来源多元化策略 191
10.6.3 资金管理与使用规范 192
附录 194
附表1 贺兰山马麝线粒体Cyt b和D-loop区联合序列单倍型 195
附图1 贺兰山马麝新旧粪堆对比 195
附图2 贺兰山地区与马麝同域分布的物种 196
附图3 贺兰山瘤孢地菇 198
附图4 贺兰山马麝活动微生境 199
附图5 贺兰山马麝分布生境 200
附图6 贺兰山马麝采食植物显微结构图（400×） 200
附图7 贺兰山马麝采食前（1）后（2）部分植物的显微结构（400×） 202
附图8 10 个微卫星位点部分扩增产物电泳信号图 203
附图9 线粒体Cyt b（左）和D-loop区（右）部分样品扩增条带图 205
附图10 贺兰山马麝的生态行为 205
附图11 野外调查 208
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