由小RNA介导的RNA沉默是真核生物调控基因表达的保守机制。本书详细阐述了植物中不同种类小RNA介导的RNA沉默途径、RNA沉默在植物生长发育及响应生物和非生物胁迫过程中的重要作用，归纳总结了植物、动物和真菌中RNA沉默机制的主要差异，并对当前研究热点——跨界RNA沉默理论及应用研究的最新进展进行了综述。
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第一章 概述 1
第一节 RNA沉默途径研究简史 1
第二节 植物RNA沉默途径抗病研究 4
参考文献 5
第二章 植物RNA沉默途径 7
第一节 转录后基因沉默 8
一、miRNA的合成及作用方式 8
二、phasiRNA的合成与作用方式 31
三、nat-siRNA的合成与作用方式 36
第二节 转录基因沉默 39
一、标准RdDM途径 40
二、非典型RdDM途径 44
三、RdDM的生物学功能 49
参考文献 51
第三章 RNA沉默调节植物生长发育及响应非生物胁迫 67
第一节 RNA沉默调控植物生长发育 68
一、转录后基因沉默调控植物生长发育的分子机制 68
二、转录基因沉默调控植物生长发育的分子机制 76
第二节 RNA沉默响应非生物胁迫 79
一、转录后基因沉默响应非生物胁迫 79
二、转录基因沉默响应非生物胁迫 85
三、RNA沉默与非生物胁迫记忆 87
参考文献 89
第四章 RNA沉默在植物.病毒互作中的功能 99
第一节 RNA沉默在植物抗RNA病毒反应中的功能 99
一、RNAi与RNA病毒 99
二、植物内源miRNA和siRNA参与RNA病毒相关抗病途径 106
三、RNA病毒产生sRNA与寄主植物基因的互作 109
第二节 RNA沉默在植物抗DNA病毒反应中的功能 111
一、RNAi与DNA病毒 111
二、DNA病毒产生sRNA与寄主植物基因的互作 117
第三节 RNAi抑制子 118
一、RNA病毒沉默抑制子 119
二、DNA病毒沉默抑制子 131
三、植物内源抑制子 143
参考文献 147
第五章 RNA沉默响应病原菌侵染 160
第一节 转录后基因沉默响应病原菌侵染 161
一、植物miRNA途径响应病原菌侵染 161
二、植物phasiRNA途径响应病原菌侵染 167
三、植物nat-siRNA途径响应病原菌侵染 171
第二节 转录基因沉默响应病原菌侵染 173
一、启动子区DNA甲基化与免疫基因表达 174
二、基因内DNA甲基化与免疫基因表达 176
三、生物胁迫响应过程中植物DNA甲基化的变化动态 178
四、生物胁迫响应过程中RdDM因子的动态变化 179
五、DNA甲基化与植物防御的远距离调控 179
六、DNA甲基化介导的预免疫现象与跨代遗传 180
参考文献 182
第六章 RNA沉默在植物与其他生物互作中的功能 189
第一节 RNA沉默在植物与线虫互作中的功能 189
第二节 RNA沉默在植物与昆虫互作中的功能 193
参考文献 195
第七章 跨界 RNA沉默 198
第一节 双向跨界RNA沉默 198
一、植物来源的sRNA进入病原菌细胞 198
二、病原菌来源的sRNA进入寄主细胞 201
三、昆虫来源的sRNA进入寄主细胞 203
四、寄生植物来源的sRNA进入寄主细胞 204
五、sRNA在植物与病原菌互作中跨界运输的模式 205
第二节 病原菌编码的沉默抑制子 212
一、细菌编码的沉默抑制子 212
二、卵菌编码的沉默抑制子 213
三、真菌中操纵RNAi的效应子 215
第三节 跨界RNA沉默的应用 216
一、利用跨界RNA沉默抗病毒 216
二、RNA沉默应用于抗虫 220
三、利用跨界RNA沉默对寄生生物进行防治 224
四、利用跨界RNA沉默对病原菌进行防治 225
参考文献 234
第八章 其他物种中sRNA形成和作用方式 249
第一节 动物中miRNA与sRNA作用方式 250
一、动物和植物中miRNA合成途径的异同 251
二、动物和植物中miRNA基因在基因组上特征的异同 252
三、动物和植物中miRNA靶标识别的异同 253
四、动物中piRNA途径 254
第二节 真菌和卵菌中miRNA与sRNA作用方式 256
一、脉胞菌中的quelling途径 256
二、脉胞菌中的qiRNA途径 257
三、脉胞菌中的减数分裂期沉默途径 259
四、裂殖酵母中由RNAi介导的异染色质形成 261
五、脉胞菌中的milRNA途径 263
六、大丽轮枝菌中的milRNA途径 264
七、其他真菌中的RNAi途径 265
八、真菌RNAi抗病毒功能 267
九、卵菌中RNAi途径 267
第三节 细菌和古菌中sRNA作用方式 268
一、细菌中由sRNA介导的抗病毒机制 268
二、CRISPR/Cas系统分类 271
三、CRISPR/Cas系统应用 274
参考文献 277
第九章 研究展望 289
第一节 miRNA进化史 289
第二节 跨界RNAi机制与应用研究 289
第三节 开发活体sRNA研究的新技术 292
参考文献 293
索引 297
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