本系列书籍初步探索“临床医生科学研究能力均等化”的对策与方法，以期为我国今后临床医生的科学研究能力规范化培养，奠定一定的基础。
第一本《科学研究的逻辑———思考、判断胜于一切》和第二本《科学研究的方法———站在巨人的肩膀上》，分别是从科学研究的具体实践和经典案例两个层面，介绍了科学研究的逻辑和方法。本书则希望书如其名，把科学研究的核心，进一步萃取和外显，变成一个可视化的、便于研究者取用的工具箱，供读者参考，具体指，在内容上，本书进一步地归纳、提炼和图示化前两本的内容（包括基本概念和操作程序），凝练成第1～5章的概念部分与第6～11章的操作部分。概念部分，力求以医学工作者的学科背景所决定的思维习惯，来逐步介绍与科学研究相关的重要概念；对概念的阐述，力求做到讲明底层原理，解释尽量配以图示类比（包括字母和函数式）以求直观明确。操作部分，则采用“全部示意图”的方式，把科学研究的整个思维过程和操作过程进行图示化表达。此外，本书作为三部曲的最后一本，在文末附录中，笔者对整个三部曲的内容结构、操作程序、共同的要素和功能逻辑进行了整体绘制，以帮助读者更好地定位、理解和使用本系列书籍。
样章试读
目录
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丛书序一
丛书序二
自序
引言
上篇 概念篇
第1章 什么是研究问题：PICOs
1 常人思维中的PICOs/3
2 PICO的类似概念/4
第2章 什么是现象、研究问题与研究假设：y=f（r1，r2，r3，r4，…，rn；x1，x2，x3，…，xm）
1 6W1H/8
2 y=f（r1，r2，r3，r4，…，rm；x1，x2，x3，…，xn）/9
（1）y/10
（2）xi与x1，x2，x3，…，xn/11
（3）ri与r1，r2，r3，…，rm/11
（4）f/12
（5）y与更好的y/12
3 6W1H与y，x，r及部分延展内容/13
4 真实世界与随机现象/16
（1）单称、全称、归纳、演绎（认知铺垫）/17
（2）随机性、确证度和α、β（逻辑思考）/24
第3章 什么是论证与证明：概率论与数理统计（数学决策）
1 常人思维论证研究假设/26
2 样本总体估计与研究假设检验/53
（1）样本总体估计/53
（2）研究假设检验/53
（3）样本总体估计与研究假设检验/53
3 概率论与数理统计基本概念树状图/53
4 概率论与数理统计最基本的逻辑推理导图/53
5 概率论与数理统计中最为重要的图/53
6 概率论与数理统计中的数学推导逻辑/59
7 三个关于/60
（1）关于常人思维很容易想到的统计分析/60
（2）关于概率/69
（3）关于分布/75
第4章 什么是研究方法：逻辑推理与事实论证
1 基本推理方式：归纳逻辑与演绎逻辑（发现与证明）/86
（1）归纳逻辑/86
（2）演绎逻辑/91
2 基本论证方式：进行归纳与演绎推理时的思维活动（研究假设与研究设计）/92
（1）事实枚举论证/93
（2）理论论证/93
（3）比较论证/93
3 基本取证方式：进行归纳与演绎推理时的操作活动（研究方法与研究工具）/95
（1）观察与描述/95
（2）调查与解释/95
（3）假说与实验演绎/96
第5章 写在快结束时的一些话：分享与探讨
1 重新认识基础、应用和开发研究/98
（1）一些认知上的误区/98
（2）基础之发现/99
（3）应用之发明/100
（4）开发之发展/101
2 学科无贵贱/101
3 一种值得推荐的思维模型（mental model）：要素—程序—结构—功能/104
（1）要素——基本构成/105
（2）程序——演进过程/操作过程/105
（3）结构——最佳实践/外显形态/行动方案/106
（4）功能——阶段目标/系统目标/106
下篇 图示篇
第6章 科学研究历程的概览图
1 Input：problem structure/111
2 Action：solution frame/112
3 Output：standard report/113
第7章 科学发现阶段-归纳
1 Input：problem structure/114
2 Action：solution frame/115
3 Output：standard report/117
第8章 科学证明阶段-计划
1 Input：problem structure/124
2 Action：solution frame/125
3 Output：standard report/126
第9章 科学证明阶段-取证
1 Input：problem structure/128
2 Action：solution frame/129
3 Output：standard report/130
第10章 科学证明阶段-论证
1 Input：problem structure/137
2 Action：solution frame/138
3 Output：standard report/139
第11章 科学研究的继往开来
1 反思上一个研究/141
2 回顾整个研究路径/142
3 启动下一个研究/143
附录：科学研究的三部曲内涵集合示意图
1 科学研究的知识结构/144
2 科学研究的外显操作/148
3 科学研究的内隐逻辑/149目录
丛书序一
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自序
引言
第1章 科学研究的方法：基础概念和基本框架
1 概念准备/1
（1）本体论、认识论、方法论、方法、原始材料/1
（2）范式和主义/3
（3）研究问题、研究假设、学科领域、研究阶段、研究类型、研究方法、研究工具、研究设计/4
2 内容地图/6
第2章 社会科学领域对社会事实的研究：涂尔干的自杀理论
1 定位/10
2 背景知识/11
（1）基本概念/11
（2）理论基础/11
3 案例研究：涂尔干的自杀现象研究/16
（1）研究问题与研究假设/16
（2）研究方法与研究工具/17
（3）研究结果与研究结论/19
（4）研究启示/20
4 主要参考文献/21
第3章 社会科学领域对社会互动的研究：库利的“镜中我”自我理论
1 定位/23
2 背景知识/24
（1）基本概念/24
（2）理论基础/24
3 案例研究：库利的“镜中我”研究/28
（1）研究问题与研究假设/28
（2）研究方法与研究工具/30
（3）研究结果与研究结论/31
（4）研究启示/32
4 主要参考文献/32
第4章 社会科学领域对社会角色的研究：波伏瓦的第二性
1 定位/34
2 背景知识/35
（1）基本概念/35
（2）理论基础/36
3 案例研究：波伏瓦的“第二性”研究/43
（1）研究问题与研究假设/43
（2）研究方法与研究工具/45
（3）研究结果与研究结论/46
（4）研究启示/47
4 主要参考文献/47
第5章 社会科学领域对社会冲突的研究：达伦多夫的群体性冲突理论
1 定位/49
2 背景知识/50
（1）基本概念/50
（2）理论基础/52
3 案例研究：达伦多夫的群体性冲突研究/54
（1）研究问题与研究假设/54
（2）研究方法与研究工具，研究结果与研究结论/56
（3）研究启示/57
4 主要参考文献/57
第6章 社会科学领域对特定人群的研究：韦德的罪犯密码研究
1 定位/59
2 背景知识/60
（1）基本概念/60
（2）理论基础/61
3 案例研究：韦德的罪犯密码研究/67
（1）研究问题与研究假设/67
（2）研究方法与研究工具/68
（3）研究结果与研究结论/68
（4）研究启示/69
4 主要参考文献/69
第7章 自然科学领域的观察描述性研究：艾滋病研究，从个案到截面
1 定位/70
2 背景知识/71
（1）个案研究/个案调查/71
（2）横断面研究/现况调查/74
（3）从个案研究起步以后/77
3 案例研究：艾滋病的发现与诊治策略提出/78
（1）第一例内在性个案研究：艾滋病的发现/78
（2）分析性概括的多个案研究：艾滋病的定义及病因学研究/79
（3）横断面调查：艾滋病患病现状的调研与防治策略的制定/80
（4）工具性个案：艾滋病诊疗的新希望/81
（5）新发现的起点：重新定义个案研究/82
4 主要参考文献/82
第8章 自然科学领域的观察分析性研究：弗莱明翰心脏研究，从截面到个案
1 定位/84
2 背景知识/85
（1）横断面研究/85
（2）病例对照研究/87
（3）队列研究/90
3 案例研究：弗莱明翰心脏研究（Framingham heart study）/93
（1）真实世界研究，从解决眼前的问题出发/93
（2）建立什么样的假设？/94
（3）选择什么样的人群？/95
（4）研究多长时间？/96
（5）得到什么结果？/97
（6）给我们的启示/98
4 主要参考文献/99
第9章 自然科学领域的个体干预分析性研究：乳腺癌预后激素替代疗法，两种不同的治疗结局
1 定位/101
2 背景知识/102
（1）随机对照试验/102
（2）随机对照试验中随机的作用/103
（3）随机对照试验中盲法的作用/103
（4）分配隐藏/104
（5）随机对照试验的设计过程与关键要点/105
3 案例研究：激素补充治疗乳腺癌的随机对照试验研究/108
（1）乳腺癌治疗的背景知识/108
（2）两项试验的研究设计与研究结果/110
（3）案例启示/116
4 主要参考文献/117
第10章 自然科学领域的群体干预分析性研究：PEACH研究，基于簇群的随机对照试验
1 定位/119
2 背景知识/120
（1）随机对照试验及其分类/120
（2）随机化及其目的/121
（3）簇群随机对照试验及其特点/121
（4）簇群内相关系数与设计效应/122
（5）广义估计方程/123
3 案例研究：社区糖尿病的簇群随机对照试验/123
（1）糖尿病治疗的背景知识/123
（2）PEACH 研究/125
（3）案例启示/130
4 主要参考文献/131
第11章 自然科学领域的群体筛查性研究：宫颈癌筛查试验，该不该找问题
1 定位/134
2 背景知识/135
（1）筛查/135
（2）诊断/137
（3）筛查试验与诊断试验的区别/137
（4）金标准与筛查试验的评价/137
（5）筛查实施的原则或条件/139
3 案例研究：宫颈癌筛查试验研究/139
（1）宫颈癌筛查的背景知识/139
（2）多种筛查策略的卫生经济学评价：代表性的三项研究/145
（3）案例启示/152
4 主要参考文献/152
第12章 趋势——基于过去、现在，预测和决策未来
1 趋势/159
2 决策与预测技术/160
（1）决策/160
（2）预测/160
（3）动态模拟技术/162
（4）常见模型及其应用领域/162
3 具体应用示例/167
（1）马尔可夫模型应用案例/167
（2）系统动力学模型应用案例/168
（3）启示与共勉/172
4 主要参考文献/172
第13章 经典——照亮黑暗的那一束光
1 再温经典/175
2 继承、创新与发展/177
（1）科学之精神/177
（2）自由之路径/177
3 站在巨人的肩膀上/178目录
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自序
引言
第1章 你眼中的科学研究，可是它真实模样？
1 引子：科学研究与时尚 1
2 科学研究是什么 2
（1）关于科研是什么 2
（2）作为临床研究者不同的科研观 3
（3）科学研究是认识世界的工具与轨道 5
第2章 洞察科学研究的本质——认识世界的工具与轨道
1 引子：从一则寓言说起 8
2 临床医生科研之困 9
3 科学研究的内在特征 10
（1）科学研究是以问题为核心的，具有问题性特征 12
（2）科学研究是一种主动建构的活动，具有建构性特征 13
（3）科学研究是一种思维的过程，具有思维性特征 15
4 科学研究的问题分类 17
（1）经验性问题与概念性问题 17
（2）探索性问题、描述性问题与解释性问题 19
（3）基础型研究问题、应用型研究问题与开发型研究问题 21
5 科学研究的5个阶段 24
6 科学研究的8个要素 27
（1）研究问题：目的，对象，方法 27
（2）研究假设：自变量、因变量、限制条件 28
（3）学科领域：学科特征、思维习惯、测量精度 28
（4）研究阶段：描述、解释、预测、控制、评价 28
（5）研究类型：研究者的介入方式、对时间的截取 29
（6）研究方法：与取证对象 数据携带者的交互方式 30
（7）研究工具：打捞目标数据的文本·变量集合 30
（8）研究设计：回答研究假设的主流程设计和保障研究信效度的质控策略 30
7 科学研究的解剖学结构 31
8 Summary：洞察科学研究的本质checklist 33
（1）科学研究的本质 33
（2）科学研究的特征 33
（3）科学研究的问题分类 33
（4）科学研究的解剖学结构（图2.17） 34
第3章 好研究的基本原则——源于工作，高于工作，回归工作
1 源于工作：做“问题本质”的研究 35
2 高于工作：做“系统性”的、“有规划”的研究 37
3 回归工作：做“可改善现状”的研究 37
4 寄语：做研究不难，做好的研究难 39
5 Summary：好研究应遵循的原则checklist 40
（1）源于工作——做“问题本质”的研究 40
（2）高于工作——做“系统性”的、“有规划”的研究 40
（3）回归工作——做“可改善现状”的研究 40
第4章 科学研究的3个阶段：如何提出研究问题——做真实而系统的研究
1 科学研究的3个阶段：这个问题是怎么提出的 41
2 第1阶段：揭示现象，克服思维惯性，在现实中你发现了什么 42
（1）揭示现象：克服思维惯性 42
（2）现象的效能：真实而稳定 54
（3）现象的描述：清晰而完整 55
3 第2阶段：锁定问题，分解现象背后的问题域，你准备研究什么 57
（1）锁定问题：使用“5W1H”分析法 57
（2）要素分属于哪些领域：制定研究路径 58
（3）你对哪个要素最感兴趣：遵从内心 61
4 第3阶段：验证问题，对锁定的问题进行验证与确认 61
（1）对同行进行验证：我的研究问题对同行来说，是否先进、实用 63
（2）对自我进行验证：我的问题在现有方法体系下能否被科学解决，是否是我能做并愿意坚持的 64
5 Summary：提出研究问题的checklist 67
（1）揭示现象——克服思维惯性，在现实中，你发现了什么（图4.15） 67
（2）锁定问题——分解现象背后的问题域，你准备研究什么（图4.16） 67
（3）验证问题——对锁定的问题进行验证与确认（图4.17） 68
（4）提出研究问题的逻辑模型（图4.18） 68
第5章 科学研究的6个步骤：如何开展科学研究——从一而终，滋润现实之花
1 第1步：根据研究问题，提出研究假设 71
（1）What：什么是研究问题与研究假设？ 71
（2）Why：提出研究问题与研究假设在整个科研活动中的独立性与重要性 76
（3）How：这一阶段有两项工作要完成 77
（4）Summary：研究问题提出前的checklist 79
2 第2步：制订研究计划 80
（1）What：什么是制订研究计划 80
（2）Why：研究计划的作用 80
（3）How：构建好研究计划的两层结构 81
（4）Summary：撰写研究计划的checklist（图5.5） 85
3 第3步：申请立项资助，接受同行评议 87
（1）What：什么是立项资助与同行评议 87
（2）Why：申请立项资助的价值 88
（3）How：撰写项目申请书的基本原则 89
（4）Summary：同行评议大于立项申请 90
4 第4步：开展研究 90
（1）What：开展研究具体包含什么 90
（2）Why：学术不端——未开展的研究 90
（3）How：项目执行策划书 90
（4）Summary：开展好研究的checklist 93
5 第5步：汇报研究成果，接受同行评议 94
（1）What：什么是汇报研究成果 94
（2）Why：为什么要汇报 94
（3）How：结题报告与学术论文报告 95
（4）Summary：水到渠成的成果汇报 97
6 第6步：研究成果转化，进入实际应用 98
（1）What：什么是成果转化 98
（2）Why：成果转化的意义 99
（3）How：如何实现成果转化 99
（4）Summary：从一而终，直至滋润现实之花 104
第6章 科学研究的第1份报告：项目申请书的写作逻辑——有理有据，非你莫属
1 What：什么是项目申请书 105
2 Why：为何要申请资助 105
3 How：如何申请资助 107
（1）申报前的6个fit 107
（2）What& Why& Would：如何撰写立题依据（图6.1） 110
（3）How：如何撰写研究内容与方案（图6.9、图6.10） 117
（4）Whyme：如何撰写基础工作与申请资质（图6.13） 123
4 Summary：撰写项目申请书的checklist（表6.1）与逻辑结构图（图6.15） 126
第7章 科学研究的渔网系列：如何采集数据——从哪里来，就到哪里去
1 What：什么是科学研究的渔网系列 128
2 Why：为什么要进行数据采集 128
（1）什么是“科学” 129
（2）科学研究的本质 129
（3）什么是数据采集 129
3 How：如何进行数据采集 131
（1）数据采集中的常见问题 131
（2）数据采集不当伤害了研究的什么？ 134
（3）以优质信效度为目标，如何更好地进行数据采集？ 140
4 Summary：数据采集的checklist（表7.2） 148
第8章 科学研究的龙骨系列：如何分析数据——洗切拼，逐盘装，不强拆，不浪费
1 What：什么是科学研究的龙骨系列 150
2 Why：为什么要进行数据分析 151
3 How：如何进行数据分析 152
（1）明确数据分析目标 152
（2）审查和清洗数据 153
（3）分析单项问题或单个变量 153
（4）交叉分析多项问题或多个变量 158
（5）其他医学领域常用的数据分析方法 169
（6）知识、逻辑、统计技能 171
（7）汇总有价值的研究成果 174
4 Summary：数据分析的checklist（表8.6） 175
第9章 科学研究的第2份报告：医学研究报告的写作逻辑——满天星星，摘最亮的几颗给你
1 What：什么是研究报告 178
2 Why：为何要报告 179
3 How：如何撰写研究报告 180
（1）研究结果的报告形式 180
（2）论文式研究报告之题目写作：回归研究问题 180
（3）论文式研究报告之作者署名：回归项目执行策划书 183
（4）论文式研究报告之摘要写作：回归研究目标 184
（5）论文式研究报告之引言撰写：回归3阶6步与整理继承知识 186
（6）论文式研究报告之材料与方法撰写：回归渔网 187
（7）论文式研究报告之结果撰写：回归龙骨 188
（8）论文式研究报告之讨论撰写：回归研究假设与创新发展知识 189
（9）论文式研究报告之志谢撰写：感谢应该感谢的人 191
（10）论文式研究报告之参考文献撰写：回归整理继承知识 191
4 Summary：撰写医学研究报告的checklist（表9.1）与逻辑结构图（图9.2） 192
第10章 归途，伟大思想伴你前行
1 秦九韶 195
（1）个人快照：数之魅力贯心宇 195
（2）人生履历：官串一生落清尘 196
（3）学术成就：亲事唯理有惊涛 197
（4）世人之见：乌龙是非不掩玉 198
（5）理性之光：谆谆之音雨荷风 199
2 皮埃尔·迪昂 200
（1）个人快照：诤诤风格 200
（2）人生履历：简单的人生遇上复杂的对手 201
（3）学术成就：各个击破的科学圣斗士 203
（4）世人之见：清澈明晰、严密一致、唯理清冷、唯法热烈 205
（5）理性之光：迪昂风范 206
3 爱因斯坦 207
（1）个人快照：朝圣爱因斯坦 207
（2）人生履历：星光轨迹 208
（3）学术成就：耳熟能详的学术贡献 211
（4）世人之见：超级大脑期待的简单、奋斗、大一统的人生 212
（5）理性之光：科学家也要谦虚，说的就是你 213
4 卡尔·波普尔 213
（1）个人快照：没当科学家的科学家 213
（2）人生履历：传奇人生，为科学家侧写 214
（3）学术成就：怀疑与对峙科学知识的身世 215
（4）世人之见：桀骜不驯的性格导致无法归属的成就 217
（5）理性之光：就是这么回事儿 218
5 拉卡托斯 219
（1）人生快照：开挂的人生是简短而直接的1 219
（2）学术成就：开挂的人生是简短而直接的2 220
（3）世人之见：开挂的人生是简短而直接的3 221
（4）理性之光：开挂的人生是简短而直接的4 222
6 归途，愿伟大思想伴你前行 223
主要参考文献
附录
附录1：《科研课题项目组成员内部协定书》 229
附录2：《多机构科研合作协议参考范本》 230
附录3：推荐给临床研究者的读书清单 233
京公网安备 11010102004214号