本书围绕鱼类样本库建设这个中心论点,回答为什么(鱼类种质资源保存和利用)、现状如何(国内外现状及现今的挑战和机遇)、怎样做(标准规范和最佳实践)、怎么用(配套数据库)等几个关键性问题,囊括鱼类样本库建设的几乎所有内容,阐述相关的生命伦理、质量控制、标准规范等重点论题,并且从鱼类样本的采集、处理、储存到基于样本的核酸提取、序列分析等均有详细的说明和指导,同时介绍鱼类样本库配套的生物信息数据库建设及模块化解决方案,让读者对鱼类样本库建设有一个全面而深入的认识。
样章试读
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前言
第一部分鱼类种质资源概述1
第一章我国主要水域的鱼类资源现状3
第二章鱼类种质资源面临的主要问题及对策7
第三章鱼类种质资源的应用前景11
第二部分鱼类样本库建设沿革与发展现状15
第一章生物样本库概述17
第二章传统鱼类样本库的建设概况21
第三章后基因组时代鱼类样本库面临的挑战24
第四章下一代测序技术催生组学级别的样本库建设28
第五章组学级别鱼类样本库的建设概况及展望31
第三部分鱼类样本库建设标准规范及最佳实践41
第一章伦理道德规范43
第二章样本库机构设置和人员培训51
第三章标准规范制定57
第四章鱼类样本采集规范59
第五章鱼类样本解剖规范63
第六章样本前处理68
第七章样本制备72
第八章样本储存85
第九章样本出入库管理89
第十章样本包装和运输96
第十一章质量控制98
第十二章文件控制100
第十三章仪器管理维护104
第十四章安全管理114
第四部分配套生物信息数据库建设125
第一章生物信息数据库127
第二章国内外鱼类信息数据库129
第三章千种鱼转录组数据库及网站建设134
第五部分模块化解决方案143
第一章样本野外采集模块145
第二章运输模块148
第三章样本库模块150
第四章鱼类精子冷冻保存模块152
第五章基因组学模块154
第六部分依托Fish-T1K项目建设的鱼类样本库和数据库157
第一章Fish-T1K项目简介159
第二章标准操作规程162
第三章Fish-T1K当前进展167
第四章Fish-T1K样本库及数据库的应用及展望171
附录1表格表单177
附录2词汇表187