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蛋白质组学:研究方法与实验方案


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蛋白质组学:研究方法与实验方案
  • 书号:9787030354334
    作者:(德)赖因德斯(Reinders,J.)
  • 外文书名:
  • 丛书名:实验室解决方案
  • 装帧:平装
    开本:16
  • 页数:441
    字数:678000
    语种:en
  • 出版社:科学出版社
    出版时间:2012-09-01
  • 所属分类:TQ9 其他化学工业
  • 定价: ¥158.00元
    售价: ¥126.40元
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  自“蛋白质组学”的概念发展以来,研究者对细胞网络的深入了解获得重要进展,但是蛋白质的丰度、动态性和相互作用等巨大的研究范围提出了更深入的挑战。本书中,蛋白质组学研究领域的专家提供了详细的技术,概述了蛋白质组学不同领域的挑战和机会,以及成功的蛋白质组学分析实例的尖端方法。本书秉承Springer《分子生物学方法》系列丛书的一贯风格,阐述明晰、便于使用,各章包括内容简介,必备材料与试剂的清单,易于操作的实验室方案、疑难问题的注意事项和易犯失误的避免。
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    前言 v
    撰稿人 ix
    第一部分 引言
    1. 蛋白质组学简介 3
    Friedrich Lottspeich
    第二部分 电泳分离
    2. 高分辨率二维电泳 13
    Walter Weiss and Angelika Gorg
    3. 非经典二维电泳 33
    JacquelineBurre,Ilka Wittig,and Hermann Schagger
    4. 蛋白质检测与定量技术用于基于凝胶的蛋白质组学分析 59
    Walter Weiss,Florian Weiland,and Angelika Gorg
    第三部分 质谱和串联质谱的应用
    5. 基质辅助激光解吸电离质谱 85
    Rainer Cramer
    6. 毛细管电泳质谱联用应用于人尿液蛋白质组学分析与生物标志物发现 105
    PetraZurbig,Eric Schiffer,and Harald Mischak
    7. 多肽纳升级液相色谱指南 123
    Thomas Frohlich and Georg J.Arnold
    8. 多维蛋白鉴定技术 143
    Katharina Lohrig and Dirk Wolters
    9. 肽段为中心的蛋白质组学技术分析血小板蛋白 155
    Oliver Simon,Stefanie Wortelkamp,and Albert Sickmann
    10. 高分辨率质谱蛋白质组分析技术鉴定小鼠小肠20S蛋白质组分子组成 173
    Reinhold Weber,Regina Preywisch,Nikolay Youhnovski,Marcus Groettrup,and Michael Przybylski
    第四部分 蛋白质组学定量技术
    11. 基于液相色谱质谱联用的定量蛋白质组学 189
    Michael W.Linscheid,Robert Ahrends,Stefan Pieper,and Andreas Kuhn
    12. 胶内酶切同位素标记蛋白质技术用于相对定量 207
    Carla Schmidt and Henning Urlaub
    13.电喷雾质谱技术用于血浆蛋白质组定量分析 227
    Hong Wang and Sam Hanash
    第五部分 质谱数据解读
    14. 算法和数据库 245
    Lennart Martens and Rolf Apweiler
    15. 鸟枪法蛋白质鉴定和质谱法蛋白质定量 261
    Bingwen Lu,Tao Xu,Sung Kyu Park,and John R.Yates III
    第六部分 蛋白质修饰分析
    16. 脑蛋白氧化修饰蛋白质组学鉴定 291
    Rukhsana Sultana,Marz ia Perluigi,and D.Allan Butter field
    17.同位素标记、磷酸化多肽亲和富集技术用于液相色谱-串联质谱蛋白质组分析 303
    Uma Kota,Ko-yi Chien,and Michael B.Goshe
    第七部分 亚细胞蛋白质组学
    18. 细胞器蛋白质组学:天然蛋白胶内酶切筛选减少样本的复杂性 325
    Veronika Reisinger and Lutz A.Eichacker
    19. 聚合物双水相系统逆流分配法分离神经系统质膜 335
    Jens Schindler and Hans Gerd NothWang
    20. 液相色谱串联质谱技术进行拟南芥蛋白质组分析的质膜蛋白富集和制备 341
    Srijeet K.Mitra,Steven D.Clouse,and Michael B.Goshe
    第八部分 蛋白质相互作用分析
    21.Strep/FLAG(SF)-串联亲和纯化标签用于哺乳动物细胞蛋白质复合物串联亲和纯化 359
    Christian Johannes Gloeckner,Karsten Boldt,Annette Schumacher,and Marius Ueffing
    22. 顺序多肽亲和纯化系统分离和鉴定大肠杆菌蛋白质复合物 373
    Mohan Babu,Gareth Butland,Oxana Pogoutse,Joyce Li,Jack F.Greenblatt,and AndreWEmili
    23. 生物信息学方法分析蛋白质相互作用 401
    Beate Kruger and Thomas Dandekar
    索引 433
    (宋凯 张春秀 译)
    Contents
    Preface. v
    Contributors. ix
    PART I INTRODUCTION
    1. Introduction to Proteomics 3
    Friedrich Lottspeich
    PART II ELECTROPHORETIC SEPARATIONS
    2. High-Resolution Two-Dimensional Electrophoresis 13
    Walter Weiss and Angelika Gorg
    3. Non-classical 2-D Electrophoresis 33
    Jacqueline Burre,Ilka Wittig,and Hermann Sch?gger
    4. Protein Detection and Quantitation Technologies for Gel-Based Proteome Analysis 59
    Walter Weiss,Florian Weiland,and Angelika Gorg
    PART III MASS SPECTROMETRY AND TANDEM MASS SPECTROMETRY APPLICATIONS
    5. MALDI MS 85
    Rainer Cramer
    6. Capillary Electrophoresis Coupled to Mass Spectrometry for Proteomic Profiling of Human Urine and Biomarker Discovery 105
    Petra Zurbig,Eric Schiffer,and Harald Mischak
    7. A Newcomer’s Guide to Nano-Liquid-Chromatography of Peptides 123
    Thomas Frohlich and Georg J. Arnold
    8. Multidimensional Protein Identification Technology 143
    Katharina Lohrig and Dirk Wolters
    9. Characterization of Platelet Proteins Using Peptide Centric Proteomics 155
    Oliver Simon,Stefanie Wortelkamp,and Albert Sickmann
    10. Identification of the Molecular Composition of the 20S Proteasome of Mouse Intestine by High-Resolution Mass Spectrometric Proteome Analysis 173
    Reinhold Weber,Regina Preywisch,Nikolay Youhnovski,Marcus Groettrup,and Michael Przybylski
    PART IV QUANTITATIVE PROTEOMICS
    11. Liquid Chromatography-Mass Spectrometry-Based Quantitative Proteomics. 189
    Michael W. Linscheid,Robert Ahrends,Stefan Pieper,and Andreas Kuhn
    12. iTRAQ-Labeling of In-Gel Digested Proteins for Relative Quantification 207
    Carla Schmidt and Henning Urlaub
    13. Electrospray Mass Spectrometry for Quantitative Plasma Proteome Analysis 227
    Hong Wang and Sam Hanash
    PART V INTERPRETATION OF MASS SPECTROMETRY DATA
    14. Algorithms and Databases 245
    Lennart Martens and Rolf Apweiler
    15. Shotgun Protein Identification and Quantification by Mass Spectrometry 261
    Bingwen Lu,Tao Xu,Sung Kyu Park,and John R. Yates III
    PART VI ANALYSIS OF PROTEIN MODIFICATIONS
    16. Proteomics Identification of Oxidatively Modified Proteins in Brain 291
    Rukhsana Sultana,Marzia Perluigi,and D. Allan Butterfield
    17. Isotope-Labeling and Affinity Enrichment of Phosphopeptides for Proteomic Analysis Using Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry 303
    Uma Kota,Ko-yi Chien,and Michael B. Goshe
    PART VII SUBCELLULAR PROTEOMICS
    18. Organelle Proteomics:Reduction of Sample Complexity by Enzymatic In-Gel Selection of Native Proteins 325
    Veronika Reisinger and Lutz A. Eichacker
    19. Isolation of Plasma Membranes from the Nervous System by Countercurrent Distribution in Aqueous Polymer Two-Phase Systems 335
    Jens Schindler and Hans Gerd Nothwang
    20. Enrichment and Preparation of Plasma Membrane Proteins from Arabidopsis thaliana for Global Proteomic Analysis Using Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry 341
    Srijeet K. Mitra,Steven D. Clouse,and Michael B. Goshe
    PART VIII ANALYSIS OF PROTEIN INTERACTIONS
    21. Tandem Affinity Purification of Protein Complexes from Mammalian Cells by the Strep/FLAG (SF)-TAP Tag 359
    Christian Johannes Gloeckner,Karsten Boldt,Annette Schumacher,and Marius Ueffing
    22. Sequential Peptide Affinity Purification System for the Systematic Isolation and Identification of Protein Complexes from Escherichia coli 373
    Mohan Babu,Gareth Butland,Oxana Pogoutse,Joyce Li,Jack F. Greenblatt,and AndreWEmili
    23. Bioinformatical Approaches to Detect and Analyze Protein Interactions. 401
    Beate Kruger and Thomas Dandekar
    Index 433
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