目录 译者的话 序 前言 编著者 第一部分:引言 1 微生物基因组学的历史 Hamilton O. Smith(3) 第二部分:作为基因组学工具的生物信息学 2 寻找基因和全基因组比较的工具 Steven L. Salzberg and Arthur L. Delcher(19) 3 TIGR 的细菌基因组注释 Owen White(31) 4 生物信息学与微生物致病作用 Fiona S. L .Brinkman and Joanna L. Fueyo(43) 5 噬菌体生物信息学 Derrick E. Fouts(62) 第三部分:核心功能 6 微生物代谢比较 Karen E. Nelson(83) 7 膜转运蛋白的基因组学分析 Ian T .Paulsen ,Katherine H .Kang ,Mark E .Hance ,and Qinghu Ren(97) 8 用基因组学分析细菌细胞周期 Michael T. Laub ,Harley H .McAdams and Lucy Shapiro(110) 第四部分:微生物基因组的进化 9 原核生物的进化及分类简史 Lorraine Olendzenski ,Olga Zhaxybayeva and J. Peter Gogarten(125) 10 细菌基因组如何变化 Timothy D .Read and Garry S. A. Myers(137) 11 基因组学时代的细菌生物多样性概念 Frederick M .Cohan(153) 12 病原菌和共生菌与寄主的协同进化 Robert A. Feldman(170) 第五部分:微生物基因组的调查 13 植物病原菌基因组调查 C .Robin Buell(185) 14 不产氧光合细菌 F .Robert Tabita and Thomas E .Hanson(194) 15 嗜热微生物基因组 Frank T .Robb(212) 16 病原肠细菌基因组 Julian Parkhill and Nicholas R. Thomson(231) 17 专性细胞内病原体 Siv G .E .Andersson(251) 18 低G + C含量革兰氏阳性细菌基因组 Steven R .Gill(266) 19 放线菌(G+ ,高G + C 含量)基因组学 Stephen D .Bentley , Roland Brosch , Stephen V. Gordon , David A. Hopwood ,and Stewart T. Cole(289) 20 寄生虫基因组学 Malcolm J .Gardner(312) 21 极端嗜盐古生菌基因组分析Shiladitya DasSarma(331) 第六部分:基因组数据库的应用 22 微阵列表达分析和细菌基因组 Carsten Rosenow and Brian Tjaden(349) 23 微生物种群基因组学与生态学 Edward F .DeLong(362) 24 基因组学在生物催化和生物降解中的应用 Lawrence P .Wackett(382) 25 酶的发现与微生物基因组学 Robert M Kelly and Keith R Shockley(397) 26 基因组学在药物发现过程中的整合 Jacques Ravel(417) 27 基因组法开发疫苗 Rino Rappuoli , Vega Masignani , Mariagrazia Pizza , Guido Grandi and John L. Telford(434) 28 微生物蛋白质组学 Svend Birkelund , Brian B. Vandahl , Allan C. Shaw and Gunna Christiansen(443) 索引 (457)